瑞士苏黎世联邦理工学院招收全奖博士
博士职位——基于三维细胞的组织模拟框架的C++软件工程
由达格玛·伊贝尔(Dagmar Iber)教授领导的计算生物学(CoBi)小组,利用先进的成像和计算工具,开发数据驱动的生物系统机理模型。我们小组融合生物学、工程学和计算科学,致力于探究细胞如何组织形成复杂组织。生物系统科学与工程系(D-BSSE)位于巴塞尔,在生物学、工程学和医学的交叉领域提供了充满活力的研究环境,且周边环绕着众多顶尖的制药和生物技术公司。苏黎世联邦理工学院(ETH Zurich)是一所致力于推动科学和技术发展的世界领先大学。
项目背景
我们正在寻找一位积极性极高的博士生,助力进一步开发SimuCell3D。SimuCell3D是一个高性能的C++框架,可在一天内模拟由数千个可变形细胞组成的三维组织,其中还包括细胞外基质和空腔[伦泽(Runser)等人,2024年,《自然·计算科学》第4卷,第299–309页;推特教程]。该平台能够以前所未有的规模研究组织力学、细胞极化和形态发生过程。
职位描述
你的职责将包括:
为SimuCell3D扩展用于反应-扩散系统的高级数值求解器
增强C++框架的生物物理功能
利用真实成像数据,将该框架应用于形态发生问题研究
在苏黎世联邦理工学院的高性能计算(HPC)基础设施上运行大规模模拟
校准模型,进行参数筛选,并根据实验数据验证预测结果
岗位要求
我们正在寻找具备以下条件的候选人:
具备扎实的C++计算技能和软件工程能力
在计算科学、应用数学或计算生物学方面拥有深厚的背景
最好熟悉偏微分方程的数值方法(如有限差分法、有限元法)
有高性能计算经验者优先,但并非必需
对生物物理学、发育生物学或细胞信号传导感兴趣(无需具备相关经验)
工作风格独立、主动且有条理
欢迎有意从该主题的论文项目起步的硕士生申请。
我们提供
根据苏黎世联邦理工学院指导方针,提供全额资助的博士职位,薪酬具有国际竞争力,并提供全面的福利
可使用苏黎世联邦理工学院的高性能计算集群和最先进的研究基础设施
支持性的跨学科研究环境
灵活的居家办公安排
众多福利,如公共交通季票和汽车共享服务、苏黎世大学体育中心(ASVZ)提供的丰富体育活动、托儿服务以及极具吸引力的养老金福利
我们重视多样性和可持续性
苏黎世联邦理工学院秉持我们的价值观,鼓励包容性文化。我们促进机会平等,重视多样性,并营造一个尊重所有员工和学生权利与尊严的工作和学习环境。请访问我们的“机会平等与多样性”网站,了解我们如何确保营造一个公平、开放的环境,让每个人都能成长和繁荣。可持续性是我们的核心价值观——我们始终致力于迈向气候中立的未来。
申请方式
我们期待收到你的在线申请,申请需包含以下文件:
求职信
简历
学位证书和成绩单
有关该小组的更多信息,请访问我们的网站。有关该职位的疑问,请通过电子邮件联系伊贝尔教授:iberd@ethz.ch(请勿通过此邮箱提交申请)。
