香港科技大学(广州)全奖博士项目(Lingluo Chu教授)

一、导师简介

香港科技大学(广州)全奖博士项目(Lingluo Chu教授)

Lingluo Chu教授2014年于中国科学技术大学完成细胞生物学博士学位后,同年进入哈佛大学生物化学与分子生物学系接受博士后训练,在Nancy Kleckner实验室工作至2019年,随后晋升为哈佛大学研究Associate,持续专注于哺乳动物染色体生物物理学。2022年起,Chu教授在香港科技大学(广州)生命科学与生物医学工程学域担任助理教授。

染色体的形态发生与不稳定性,构成了Chu教授实验室的研究核心。活体成像、CRISPR/Cas9、光遗传学、图像识别、机器学习以及三维模拟重建,这些技术共同构成了研究 chromosome assembly 与 segregation 的分子-物理机制的工具箱。目标是阐明染色体不稳定性在疾病中的发生机制,并提供诊断治疗的细胞学证据。

二、近期文章和项目解析

香港科技大学(广州)全奖博士项目(Lingluo Chu教授)

(1)染色体分离的三阶段程序

2022年《Proc. Natl. Acad. Sci. U S A》刊载的论文中,Chu以第一作者身份报告:姐妹染色单体在后期分离时,遵循由轴间桥指令的三阶段程序。传统观点视后期分离为同步事件,此项研究凭借高分辨率实时成像揭示了逐步推进的精细过程。

人工分析:将物理概念(轴间桥)引入染色体分离研究,构成了这项工作的独特视角。多数研究聚焦分子马达,而此项工作强调染色体结构本身对分离动力学的调控作用。染色体不稳定性可能源于结构缺陷,而非单纯分子调控失效。肿瘤细胞中常见的染色体分离错误,或许能通过轴间桥的异常持续时间或断裂模式进行诊断。

(2)染色体形态发生的力学基础

2020年《Proc. Natl. Acad. Sci. U S A》发表的研究中,Chu作为第一作者与共同第一作者提出:沿有丝分裂染色体分布的一维空间模式,其力学约束构成了宏观形态建成的物理基础。这挑战了染色体形态完全由分子信号决定的观点。

人工分析:方法论层面的创新是此项工作的核心贡献。传统路径寻找"关键分子",而此项研究将染色体视为物理对象,关注机械特性如何约束分子事件的空间分布。染色体结构畸变可能改变局部力学环境,反馈影响信号传导效率。三维模拟重建技术的应用表明,实验-计算交叉验证已成为领域标准。跨学科背景(物理或工程)的申请者将获得明显优势。

(3)有丝分裂染色体的三维拓扑结构

同期发表于《Mol Cell》的论文中,Chu以第一作者身份系统绘制了有丝分裂染色体的三维地形图。研究整合超分辨成像与计算建模,揭示了染色体内部组织原则。

人工分析:此项研究回应了领域内的基础问题——高度凝缩的染色体如何维持内部有序性。三维地形图的提供不仅是结构参考,更关键的是发现拓扑结构域与功能区域存在对应关系。这种"结构-功能"对应范式在细胞生物学中始终占据核心位置。染色体不稳定性可能表现为拓扑结构破坏,进而影响基因表达或DNA修复。机器学习在图像识别中的应用说明,处理复杂结构数据时,AI已成为必要工具而非装饰。

(4)PLK1调控机制的协作研究

2021年《Cell Rep》刊载的论文中,Chu参与了Apolo1对PLK1反馈调控机制的解析。PLK1作为有丝分裂关键激酶,其活性时空动态通过FRET传感器实现了定量分析。

人工分析:Chu很可能在此项研究中贡献了活体成像与定量分析专长。PLK1活性实时监测的技术门槛较高,FRET传感器的构建与应用体现了实验室的技术纵深。反馈调控机制的发现解释了两个问题:有丝分裂检查点为何具有鲁棒性,以及系统如何通过正负反馈平衡准确性与速度。这对理解染色体不稳定性综合征(CIN)有直接意义——反馈环路断裂可能导致检查点失效。

(5)SET7/9介导的PLK1甲基化

2019年《J Mol Cell Biol》发表的研究中,Chu担任合作作者。工作发现SET7/9甲基转移酶通过甲基化PLK1的Lys191位点抑制激酶活性,从而调控动粒-微管动态。

人工分析:表观遗传修饰与信号转导在此项研究中发生交叉。非组蛋白底物的甲基化直接影响激酶活性,Lys191位点靠近ATP口袋,甲基化可能通过空间位阻限制ATP结合。这提示细胞代谢状态(SAM浓度)可能影响有丝分裂准确性。SET7/9表达异常可能通过PLK1导致染色体不稳定性,为癌症表观遗传学提供了新线索。

(6)LRIF1-HP1α相互作用

2018年《J Mol Cell Biol》论文中,Chu作为合作作者鉴定了LRIF1通过HP1α的chromoshadow域将其招募至中期动粒,该互作对Aurora B激酶活性至关重要。

人工分析:HP1α在间期与有丝分裂的定位机制差异长期存在认知空白,此项研究填补了这一缺口。LRIF1作为"桥梁"蛋白,其功能不在于催化,而在于组织空间排布。染色体不稳定性的遗传突变谱可能不仅包括酶类基因,还包括大量结构蛋白。膜通透性竞争肽的应用证明互作位点具备成药性,为干预染色体分离错误提供了潜在靶点。

三、未来研究预测

(1)AI驱动的细胞动力学分析

"Cell dynamics and AI"已被明确列为研究方向。专用深度学习模型的开发可能成为未来重点,用于预测染色体行为从相关性走向因果性。

人工分析:当前AI应用多停留在图像分割,真正的突破在于因果性预测。例如,根据早期有丝分裂事件预测后期分离准确性,或模拟特定基因扰动下的染色体形态变化。这对数据质量和计算资源要求极高,HKUST(GZ)新建的高性能计算平台可能提供硬件支持。

(2)染色体不稳定性与先天免疫的交叉研究

研究兴趣列表包含"Chromosome instability and innate immunity"。染色体异常产生的微核可激活cGAS-STING通路,Chu实验室可能探索染色体结构缺陷如何被免疫系统识别。

人工分析:染色体不稳定性高的肿瘤通常免疫原性更强,机制尚不明确。Chu教授的染色体动力学背景使其能精确操纵微核形成率,结合HKUST(GZ)的免疫学研究团队,可能揭示结构畸变与免疫激活的定量关系。这种跨学科问题最适合多学科交叉平台。

(3)活细胞超分辨成像的技术迭代

当前研究已使用高时空分辨成像,未来发展方向可能指向更低光毒性、更长时程的成像技术。

人工分析:技术升级的关键在于平衡分辨率与细胞健康。传统超分辨成像光毒性高,不适合长达数小时的有丝分裂全程观测。新的自发光探针或低强度成像策略可能是突破点。Chu教授在哈佛积累的生物物理技术经验将在这一点发挥作用。

(4)染色体结构的机械药理学

基于力学基础研究成果,未来可能筛选影响染色体刚性的化合物,通过改变机械特性干预分离过程,而非靶向特定激酶。

人工分析:机械药理学是新兴概念。传统药物靶点多为酶或受体,机械靶点则是细胞骨架或核基质。染色体刚性调控可能避免对正常细胞产生毒性,因为癌细胞染色体不稳定性更高,对机械干扰更敏感。这种策略需要与药物化学家深度合作。

(5)三维基因组与细胞分裂的时空调控

结合Hi-C等三维基因组学数据,研究染色质相互作用如何在有丝分裂中动态重排,以及这对子细胞基因表达记忆的影响。

人工分析:有丝分裂后子细胞如何"记住"母细胞基因表达状态?三维基因组结构可能是表观遗传记忆的载体。Chu教授的3D重建技术可直接应用于探索分裂过程中拓扑相关结构域(TADs)的命运,可能改写我们对细胞身份维持的理解。

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