01、项目概述
卢森堡大学系统生物医学中心(LCSB)目前招收一名全额资助的博士研究生，参与"微生物组时代的病理学"(MICRO-PATH)研究项目。该项目探究微生物组衍生蛋白质在神经退行性疾病中的作用机制，特别关注它们如何作为蛋白质聚集的种子影响阿尔茨海默病和帕金森病等疾病进程。这是一个为期36个月(3年)的全职职位，年薪高达41,976欧元(税前)，工作地点位于卢森堡Campus Belval校区。
MICRO-PATH是一个高度竞争性、跨学科、研究密集型的博士培训项目，由卢森堡国家研究基金(FNR)的PRIDE资助计划支持，合作机构包括卢森堡大学、卢森堡健康研究所和卢森堡科学技术研究所。该项目旨在解决基于微生物组介导的病理发生的因果和机制研究问题，为未来将微生物组建立为治疗和预防目标奠定基础。
02、卢森堡大学及LCSB研究中心介绍
卢森堡大学是一所具有鲜明多语言和跨学科特色的国际研究型大学，成立于2003年，是卢森堡唯一的国立高等教育机构。卢森堡系统生物医学中心(LCSB)是卢森堡大学的一个跨学科研究中心，专注于神经退行性过程研究，特别是阿尔茨海默病和帕金森病及其相关因素。该中心汇集了来自50多个国家的计算机科学家、数学家、生物学家、化学家、工程师、物理学家和临床医生，通过跨学科合作解决复杂生物医学问题。
LCSB成立于2009年，旨在通过弥合系统生物学与医学研究之间的差距来加速生物医学研究。中心采用系统级方法，深入了解人类疾病的分子和细胞机制，重点关注神经退行性疾病。中心已与全球领先的生物医学实验室以及卢森堡所有主要生物学和医学研究单位建立了战略合作伙伴关系，推动基础研究成果转化为临床应用，开发新的诊断工具和治疗方法。
LCSB在神经退行性疾病研究领域享有盛誉，是"帕金森病国家卓越研究中心"(NCER-PD)的重要组成部分，后者是卢森堡大学、卢森堡健康研究所、卢森堡综合生物银行和卢森堡中央医院的联合研究项目，旨在结合他们在帕金森病方面的临床、生物医学和计算专业知识。该中心还参与多个国际研究项目，如ORCHESTRA和CoVaLux，并主持卢森堡ELIXIR国家节点，专注于转化医学工具和数据的长期可持续性。
03、微生物组与神经退行性疾病研究背景
近年来，大量研究表明脑-肠-微生物组轴在神经退行性疾病中发挥关键作用。神经退行性疾病的主要共同组织病理学特征是特定蛋白质在细胞内外错误折叠和聚集。人体微生物组已被证实与帕金森病和阿尔茨海默病等神经退行性疾病的发生和进展密切相关。
在这些疾病环境中，微生物组衍生的分子，如淀粉样蛋白（包括细菌卷曲蛋白）被认为会触发和加剧疾病过程。研究表明微生物组衍生的淀粉样蛋白可能作为种子促进大脑中人类淀粉样蛋白的聚集，从而加速疾病进展。
肠道微生物产生的代谢物三甲胺N-氧化物(TMAO)可能在肠道菌群失调与神经功能障碍和神经退行性变之间的联系中发挥重要作用。研究发现，升高的TMAO水平与神经炎症增加、蛋白质错误折叠和聚集、氧化应激以及神经元信号传导受损有关，这些都是阿尔茨海默病和帕金森病的特征。
此外，S100A8和S100A9蛋白具有本质上淀粉样的氨基酸序列，可以形成淀粉样寡聚体和纤维，这些结构与淀粉β和α-突触核蛋白等淀粉样多肽非常相似。研究显示，阿尔茨海默病患者的脑脊液和大脑中钙卫蛋白水平显著升高，这促进了其淀粉聚集和与Aβ的共聚集。
04、MICRO-PATH项目与研究内容
"微生物组时代的病理学"(MICRO-PATH)是一个高度竞争性、跨学科、研究密集型的博士培训项目，由卢森堡国家研究基金(FNR)的PRIDE资助计划支持。PRIDE是FNR资助卢森堡博士研究的主要计划，旨在吸引优秀的PhD候选人到卢森堡，并提供高质量的研究培训，支持关键研究领域的发展。在该计划下，一批博士助学金被授予围绕一个连贯的研究和培训计划的优秀研究人员联合体。
MICRO-PATH的合作机构包括卢森堡大学、卢森堡健康研究所和卢森堡科学技术研究所。该项目专注于基于微生物组介导的病理发生的因果和机制研究，其愿景是以集中方式应对微生物组相关挑战，为将微生物组建立为未来治疗和预防目标奠定基础。
本次招聘的博士项目将在LCSB的系统生态学研究组进行，研究微生物组衍生蛋白质作为神经退行性疾病中蛋白质聚集的种子。具体研究目标包括：
1. 开发微生物组来源淀粉样蛋白的高级注释
2. 探究微生物组来源淀粉样蛋白与神经退行性疾病相关人类蛋白之间交叉种子作用的机制洞察
博士候选人将对阿尔茨海默病或帕金森病患者肠道微生物组的多组学数据进行计算分析。研究将使用最先进的体内蛋白质结构预测方法和体外筛选方法，系统地阐明肠道宏蛋白组的淀粉样潜力。具体来说，将使用先进的AI基础蛋白质结构预测工具分析基因目录和基因组集合以及内部组学数据，识别蛋白质中易聚集区域，并开发预测淀粉样潜力的新方法。
此外，研究还将从各种组学数据集中识别差异丰度蛋白质，用于确定与神经退行性疾病相关的关键蛋白质。最有前景的候选物将使用先进的对接和动力学模拟技术进行评估，提供关于其潜在相互作用的见解。为进一步证实这些候选物的淀粉样潜力，还将进行体外蛋白质聚集试验。
05、卢森堡研究环境与FNR资助体系
卢森堡国家研究基金(FNR)是卢森堡的主要研究资助机构，为包括博士研究在内的多种研究活动提供资金支持。PRIDE计划于2015年启动，是FNR资助卢森堡博士研究的主要项目，项目期限最长可达6.5年。该计划旨在通过吸引优秀的PhD候选人到卢森堡并提供高质量的研究培训，支持关键研究领域的发展。
PRIDE资助包括:
1. 特定数量的博士助学金(每项包括相当于4年博士就业合同+6,500欧元的培训和流动津贴)
2. 每项博士助学金支付给博士培训单位10,000欧元的一次性费用，用于培训和其他直接成本
2015年第一轮PRIDE计划产生了135个FNR资助的博士职位，分布在11个博士培训单位和卢森堡6个研究领域。2017年PRIDE计划向6个成功的博士培训单位提供了75个博士职位。所有通过PRIDE资助的博士生都将获得与其主办机构的就业合同，候选人最多可获得4年资助。
卢森堡的博士教育和研究环境十分国际化和多元化。卢森堡大学积极鼓励来自各种背景的学生申请，包括那些来自代表性不足群体的学生，致力于提供无障碍和包容的环境，使所有博士候选人能够茁壮成长并充分发挥潜力。该校重视多元化的员工和学生社区，保持一种让每个人都能和谐共处、相互尊重的文化氛围。
06、申请要求与资格条件
本项目面向早期研究人员开放，即未获得博士学位，处于研究生涯前四年(全职研究经验等效)的研究人员，从获得使其有资格开始攻读博士学位的学位之日起计算。申请者需要在生物信息学、生物学或相关领域拥有硕士学位。
关键资格和素质要求包括：
1. 具备生物信息学/计算生物学经验；蛋白质结构预测经验被视为重要资产
2. 工作风格结构良好且自主，良好的组织和沟通能力
3. 英语流利(书面和口语)；德语和/或法语是加分项
4. 具有团队合作精神
合同类型为固定期限合同36个月(3年)，全职每周40小时工作，地点位于Campus Belval校区。卢森堡大学为每位全职博士生提供41,976欧元的年薪(税前)，这在欧洲范围内是颇具竞争力的薪资水平。
07、项目福利与发展机会
MICRO-PATH博士培训项目提供了全面的培训和职业发展机会：
1.跨学科培训环境：项目结合了多个机构的专业知识，为博士生提供跨学科的研究培训，涵盖微生物组学、神经科学、计算生物学等多个领域。
2.可转移技能培训：除了专业研究技能外，项目还提供职业发展支持、国际专家讲座和教学以及年度博士研讨会，培养项目管理、技术写作和团队合作等可迁移技能。
3.国际学术环境：卢森堡大学拥有来自90多个国家的员工，提供真正的国际化学术环境。MICRO-PATH项目鼓励研究人员参加国际会议，加入欧洲和全球联盟，邀请合作者到卢森堡交流。
4. 现代化研究设施：LCSB拥有六个科学平台，提供成像、组学、数据科学和动物模型等服务。研究人员可以使用最先进的设备进行研究，包括蛋白质结构预测、AI分析和体外筛选等技术。
5.临床合作机会：LCSB与医院和医疗专业人员密切合作，获得多个领域如神经学、病理学和神经外科的医生和临床研究人员的宝贵意见，这对开发干预治疗或基于生物标志物的新诊断工具以及测试其在临床中的有效性至关重要。
6. 产业联系：LCSB已与领先的生物医学实验室和行业伙伴建立了战略合作关系，为博士生提供接触实际应用和产业界的机会，促进基础研究成果向临床应用的转化。
08、申请建议
1.突出计算生物学背景：由于项目需要对多组学数据进行计算分析，申请者应重点强调其在生物信息学、计算生物学方面的经验，特别是蛋白质结构预测相关技能。如有相关软件工具使用经验（如Python、MATLAB等），应详细说明。
2. 展示跨学科知识：鉴于项目的跨学科性质，展示对微生物组学、神经科学、蛋白质生物学等多个领域的了解将是加分项。在申请材料中可以提及如何将不同学科的知识整合应用于研究问题。
3.强调研究方法技能：详细描述在多组学数据分析、AI应用、蛋白质结构模拟等方面的技能和经验。如有使用高性能计算、大数据分析工具的经验，应予以突出。
4.制定个性化动机陈述：在简历中明确说明对该职位的动机、相关过去经历和未来兴趣。将自己的研究兴趣与MICRO-PATH项目和LCSB的研究方向紧密联系，展示申请者如何能够为项目做出独特贡献。
5.准备完整申请材料：确保申请材料包括详细简历、求职信、相关文凭副本(显示成绩)、出版物清单(如适用)以及两位推荐人的联系信息。材料需要使用英语撰写，且必须通过正式的在线系统提交。
6.了解卢森堡研究环境：在申请前，深入了解卢森堡大学、LCSB和FNR的研究环境和支持体系。熟悉PRIDE计划的特点和要求，这将有助于在申请和面试中展示对机构的了解。
7.突出语言能力：项目要求英语流利，德语或法语为加分项。如有相关语言证书或能力证明，应在申请中予以说明。在国际化的研究环境中，多语言能力是重要优势。
8.展示团队合作精神：LCSB强调跨学科合作和团队工作，因此应在申请中展示良好的团队合作能力和沟通技巧。举例说明过去成功的团队合作经历将很有帮助。
9.尽早申请：项目鼓励尽早申请，因为申请将在收到后立即处理。提前准备材料，确保在截止日期前有充分时间完成申请流程。
10.准备研究提案：虽然不是必需的，但准备一份简短的研究构想，说明你对微生物组蛋白质在神经退行性疾病中作用的理解和可能的研究方向，将显示你的主动性和对项目的理解程度。
【竞赛报名/项目咨询+微信：mollywei007】
