英国牛津大学3年制全奖PhD博士项目!

英国3年制全奖PhD博士项目!

该项目依托于牛津大学的Botnar Research Centre,其下属的Health Data Sciences(HDS)团队是一支多学科研究力量,成员超40人。团队成员背景多元,地理来源广泛,知识领域互补,可支撑从研究设计到报告的全流程工作。团队在健康数据科学、流行病学、药物流行病学、药物基因组学及机器学习等领域拥有深厚 expertise,同时是国际联邦网络中的活跃数据合作伙伴,具备访问多个临床真实世界数据(RWD)来源的条件。

一、项目简介

这是一项为期3年的Competition Funded PhD Project,面向全球学生开放,研究方向聚焦数据科学与健康信息学交叉领域。项目核心旨在解决真实世界数据库与其向通用数据模型(Common Data Models, CDMs)转换过程中的关键问题——目前缺乏成熟方法度量源RWD与转换后版本的相似性或距离。

团队在Observational Medical Outcomes Partnership(OMOP)CDM(应用最广泛的CDM之一)及数据提取、转换和加载(ETL)流程方面拥有丰富经验,项目将通过开发创新度量方法和检测工具,强化数据转换过程并提升结果数据的有效性。

二、工作内容

  1. 开发相似性与距离度量方法:针对真实世界数据(RWD)与其转换后的OMOP CDM版本,设计新颖的数学相似性和距离度量指标。需结合数据标准化、数据 harmonisation 理论,确保方法能准确反映源数据与目标模型间的结构及内容差异,为数据转换质量评估提供量化依据。
  2. 创建数据转换检测工具:研发可识别数据转换中错误或不完整情况的工具。工具需兼容医疗健康数据的复杂性,能对ETL流程中的数据映射、格式转换等环节进行自动化校验,助力提升 observational research 中数据质量的可控性。

三、福利待遇

  1. 专项培训支持:提供真实世界数据(医疗记录、遗传数据)的实操培训;第一学期需完成核心课程学习,内容涵盖肌肉骨骼生物学、炎症、表观遗传学、转化免疫学、数据分析及微生物组等,夯实跨学科知识基础。
  2. 学术交流与网络资源:支持参加相关国际会议,提供有限的差旅资助;可参与欧洲健康数据与证据网络(EHDEN)、观察性健康数据科学与信息学(OHDSI)等国际网络,获取额外指导与协作机会;定期参与部门研讨会、每两周一次的健康数据科学会议,需在会议中汇报研究进展。
  3. 多元技能提升:可访问医学科学部技能培训团队及其他部门开设的各类课程;需参加NDORMS组织的为期2天的统计与实验设计课程,提升研究设计与数据分析能力。

四、申请建议

1.学历与专业背景:

  • 需拥有或预计获得相关学科(如数据科学、生物统计学、流行病学、健康信息学等)的一等或二等一荣誉学士学位及以上学历;
  • 非英语母语者需提供英语语言能力证明。

2.技能储备:

  • 具备扎实的数据分析基础,熟悉机器学习算法者优先;
  • 了解医疗健康数据特点或有数据标准化、ETL流程实践经验者更具优势;
  • 掌握Python、R等数据分析工具及数据库操作技能。

五、对该职位的理解和创新想法

该项目聚焦真实世界数据转换质量这一 observational research 中的关键缺口,对提升医疗健康数据应用价值具有重要意义,可以从以下角度进行思考:

  • 结合图神经网络(GNN)构建源数据与OMOP CDM的结构映射模型,通过节点嵌入实现相似性的动态度量;
  • 将联邦学习思想融入检测工具开发,在保护数据隐私的前提下实现多中心数据转换质量的协同评估。

申请者应当深入研读OMOP CDM相关技术文档及现有数据质量评估研究(如招生内容中提及的参考文献),在研究计划中明确自身方法与现有成果的差异点;同时主动了解EHDEN、OHDSI网络的研究热点,思考如何将项目成果与国际协作网络需求结合,增强申请竞争力。

【竞赛报名/项目咨询+微信:mollywei007】

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