香港大学博士导师(Che You教授)

01、招生要求

香港大学研究生院规定博士申请人须满足以下基本条件:

- 学历资质:持有认可大学一等荣誉学士学位或同等资格;或荣誉学士学位加硕士学位。研究型硕士毕业生可申请三年制博士课程。

- 标准化考试:五年内的GRE或GMAT成绩报告。GRE机构代码2482,GMAT代码FS2-WL-48。

- 语言能力:非英语教学背景申请人需提供两年内有效英语成绩。托福网考最低85分,雅思学术类总分不低于6.5且单项不低于6.0。

- 申请材料:在线申请表、本科及研究生成绩单与毕业证书、6-8页研究计划、两封学术推荐信(由推荐人直接提交)。

- 截止日期:香港博士奖学金计划及大学主申请通常于每年12月1日中午截止。

奖学金体系包含:

- 香港博士奖学金计划:每月津贴28,100港元,持续三年,可延长;每年14,200港元会议及研究差旅津贴。

- 港大校长博士奖学金:四年总计约219,300美元,含现金奖励、学费豁免及住宿保障。

02、研究方向

【全奖】香港大学博士导师(Che You教授)

Dr. Che You现任香港大学公共卫生学院公共卫生实验室科学分部助理教授(研究)。其学术履历包含美国国立卫生研究院博士后研究经历,以及在香港大学获得环境微生物学博士学位的背景。实验室聚焦微生物组、抗菌素耐药性及病原体的相互作用机制。

Che You实验室主要开展以下研究:

皮肤微生物组恢复机制

针对造血干细胞移植患者,研究团队分析免疫重建过程中皮肤微生物群落的动态恢复模式。2024年提交至学术期刊的研究论文阐述了移植后皮肤微生物组如何随免疫恢复而重建。

推荐

抗菌素耐药性的环境维度

博士阶段研究聚焦于环境中耐药基因的传播。PNAS 2021年发表的论文揭示接合质粒与插入序列协作塑造耐药基因水平转移的机制。Microbiome期刊2019年和2022年连续发表两项研究,分别阐释废水处理厂中移动耐药组及WWTP与人类/动物相关细菌间耐药性的多层 hierarchical 转移路径。

多界微生物组多样性

实验室采用纳米孔测序、单细胞和空间转录组学技术,研究皮肤与肠道微生物群落在健康与疾病状态下的多界多样性、适应与进化。2023年发表于Genome Biology的论文构建早期人类皮肤微生物组基因组目录,包含9,483个原核生物基因组、206个真菌基因组及39个真核病毒序列,将皮肤微生物组分类率提升21%。

耐药组与移动遗传元件

通过大数据分析揭示耐药组及相关移动遗传元件。研究发现,废水处理厂是耐药基因扩散的关键枢纽,耐药基因通过质粒、转座子等元件在细菌群落中传播。

噬菌体治疗策略开发

针对全球抗微生物耐药挑战,团队致力于开发噬菌体疗法。通过解析噬菌体-宿主相互作用网络,筛选针对性噬菌体以清除耐药病原体。

03、有想法

构想一:单细胞分辨率下的皮肤微生物组-宿主互作时空图谱

整合单细胞RNA测序与空间转录组学,构建免疫抑制患者皮肤微环境中每个细胞的转录状态与空间定位图谱。分析角质形成细胞、免疫细胞与微生物的物理邻近关系如何影响基因表达。此研究可揭示特定微生物定植如何调控宿主防御基因表达,为精准干预提供空间靶点。

构想二:基于纳米孔测序的AMR现场快速诊断平台

开发便携式纳米孔测序工作流程,实现临床样本中耐药基因的现场检测。优化从样本处理到数据分析的全流程,将周转时间缩短至6小时内。结合机器学习算法预测耐药表型,指导抗生素即时选择。

构想三:噬菌体-耐药菌共进化的实验性进化研究

在体外模型中构建噬菌体与耐药菌的共进化系统,长期传代追踪噬菌体逃逸突变与细菌抗性突变的动态平衡。通过全基因组测序解析共进化的分子机制,识别噬菌体广谱突变体。

构想四:环境-宿主界面耐药基因转移的风险评估模型

整合宏基因组数据与流行病学参数,构建数学模型量化废水处理厂耐药基因向人体微生物组转移的风险。模型纳入基因 mobilization 潜力、宿主范围、环境持久性等变量,预测高风险耐药基因亚型。

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